본 협회(회장 민홍기)는 2008년 7월 2일(수)에 협회와 한국해양수산연수원의 관계자 20여명이 참석한 가운데 민원센터 개소식을 열고 본격적인 민원업무를 시작했다. 협회는 한국해양수산연수원과 업무협약을 체결에 따라 해기사회관 3층에 약 35평의 공간을 확보하여 민원센터를 개소하고 협회 회원을 위한 기존의 각종 민원 편의 제공은 물론이고, 연수원의 해기사시험접수 및 교육증서 발급업무를 대행함으로서 한 단계 진전된 서비스를 제공하게 되었다. 특히, 기존에 선원복지고용센터에서 대행해 오던 해기사시험접수 및 연수원 교육증서 발급업무를 해기사협회가 공백 없이 이관 받음으로써 해기사를 포함한 민원인들의 불편함이 없이 민원을 처리할 수 있게 되었다.